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苏州发现新冠肺炎新品种?专家说没有必要恐慌

2022-04-06 11:41:00 来源:科技日报

4月2日,苏州市疾控中心在疫情发布会上介绍,苏州发现了Omicron BA.1.1的进化分支,在很多数据库中都没有发现新冠肺炎基因组的高度同源序列。

奥米克隆在中国出现前所未有的新突变?这种突变是如何出现的?新冠肺炎又进化了吗?疫情还能预防吗?

虽然苏州疾控中心强调,需要一段时间分析比较,才能发布进一步的信息。然而,这种新的突变仍然引起了广泛的关注和大量的猜测,并登上了热搜。带着以上问题,科技日报记者采访了国家数据平台上的一位病毒学家。

仅凭测序相似性来判断还为时过早。

“说‘没有发现高度同源的序列’是不够科学的。”这位专家说,首先,报告想表达的应该是“高度相似的序列”。在生物进化研究中,“同源性”只能描述为“是”或“不是”;其次,“身高”的含义不够准确,99.9%和99%可能被认为是“身高”,但两者相似度的差异导致序列数变化超过200个核苷酸;最后,基因组序列的改变并不意味着病毒的传播性、传染性、致病性等必然会发生变化。不能只根据序列差异的多少来判断是否出现了新的流行突变株,而要进一步分析序列突变是否引起了相应氨基酸的变化,这种突变发生在哪个蛋白中,如果是重要蛋白,是否在关键区域。只有在所有这些研究都搞清楚之后,我们才能知道这种新菌株的可能后果。因此,在披露奥米克隆的“新分支”时,必须同时公布突变位点。

是否是“新分支”,目前不确定。

苏州疾控中心报告称,奥米克隆突变株BA.1.1进化分支的发现,表明其发生了一定程度的突变。

"对于新冠肺炎的新分支,国际上有不同的定义."这位专家告诉科技日报记者,有些定义很宽泛,有些很详细。学术界有不同的分类方法,制定了不同的标准。

据科技日报记者查阅文献,在分析了新冠肺炎的35000多条基因组信息后,有学者于2020年7月提出了动态命名法“PANGO”,其他学者也提出了不同的分类方法。

以广泛使用的“PANGO”方法为例。这个办法规定:一个新的分支,必须有充分的系统发育证据,证明在不同地理区域人群的流行过程中,后代谱系从祖先谱系到后代谱系的演变过程,也就是说,该分支必须实质性地向前扩散。目前只从一个感染者身上检测到这种变异序列,很难确认其实质性的正向传播,因此可能无法定义为新的分支。

“新分支”可能会“自生自灭”,这并不奇怪

“这轮局部疫情已经持续一个多月了。按照新冠肺炎的突变率,大概有两个突变是正常的。”这位专家说,然而,这并不意味着新冠肺炎的每一个新分支都将成为严重的变异菌株。只有相对“适应”的病毒才能存活,即使存活,也不一定能发展成主流毒株。

“如果你回到delta菌株,你会发现它有很多分支AY.1,AY.2……AY.133,但最终成为主流的只有少数。”这位专家解释说,大量分支机构在普及过程中“自生自灭”。因此,即使出现新的分支,也不必过度恐慌。最终,该分支可能不会形成主流,并且它很少会发展成更具传染性和致病性的菌株。

重要的是从世界各地收集大量新冠肺炎阳性人群样本进行病毒基因组测序,利用生物信息学方法密切监测变异,及时发现主流毒株,开发有效的疫苗、抗病毒药物和检测试剂,实现疫情防控。

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