近日,中国疾病预防控制中心专家谈及奥米克龙突变株的检测,指出对奥米克龙突变株的基因组分析显示,其突变位点不位于我国第八版公布的核酸检测试剂引物和探针的靶区,但不影响我国主流核酸检测试剂的灵敏度和特异性。
也就是说,虽然Omicron株有很多突变,但国内现有的核酸检测试剂仍然可以准确检测到。记者查看了第八版《新型冠状病毒肺炎防控方案》附件中公布的核酸检测方法,显示新冠肺炎核酸检测的主要靶标是病毒基因组中的开放阅读框1ab(ORF1ab)和核衣壳蛋白(N蛋白)。这些概念是什么意思?记者采访了上海交通大学医学院上海免疫研究所教授王赢。
王赢介绍,新冠肺炎主要有四种结构蛋白,包括刺突蛋白(S蛋白)、核壳蛋白(N蛋白)、膜蛋白(M蛋白)和包膜蛋白(E蛋白)。此外,新冠肺炎基因组编码的ORF1a和ORF1b蛋白属于非结构蛋白,主要负责编码与病毒复制和转录相关的酶,帮助新冠肺炎肆虐宿主细胞。对不同新冠肺炎株的序列分析表明,ORF1ab的核酸序列相对稳定,突变概率较低。
Omicron突变体的突变位点主要集中在刺突蛋白上,因此不影响编码N蛋白和ORF1ab蛋白基因的检测。例如,如果新冠肺炎随身携带各种身份证件,那么核酸检测就像是通过查看“通缉犯”新冠肺炎的身份证件来“找出”他。现有的核酸检测可以根据新冠肺炎的身份证和护照信息来判断他的“身份”,但在Omicron突变后,主要是改变了驾照信息,并不影响他身份判断的准确性。
此外,同时检测两个目标也给核酸检测的准确性“双保险”。根据第8版《新型冠状病毒肺炎防控方案》,用荧光RT-PCR检测了新冠肺炎两个靶标——的开放阅读框1ab和核衣壳蛋白。在两种情况下,实验室可以确认标本所有者为阳性病例:第一,同一标本中两个靶标的结果均为阳性;二是两种标本(如同一人鼻咽拭子、口咽拭子)同时显示单靶阳性,或同一类型标本两次显示单靶阳性。
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