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“地球生物基因组计划”开始全面测序

2022-01-19 11:45:00 来源:科技日报

1月18日电 全球绘制所有已知植物、动物、真菌和其他微生物的生命基因组图谱的努力正进入一个新阶段,从试点项目到全面测序。地球基因组计划(EBP)的这一新阶段的标志是在最新一期《美国国家科学院院刊》上发表的一系列论文,这些论文描述了该计划的目标、迄今取得的成就和下一步行动。

加州大学戴维斯分校进化与生态学杰出教授、EBP工作组主席Harris Levin说:“EBP的本质是,它是生物学史上最大的合作努力。从基础科学到突破性应用,解决了防止生物多样性丧失、粮食作物适应气候变化等一系列紧迫的全球性问题。”此外,它使“所有真核生物测序的最终目标触手可及”。

EBP于2018年11月推出。它的目标是提供所有180万命名植物、动物和真菌以及单细胞真核生物的完整DNA序列目录。

如果不采取行动遏制气候变化,保护全球生态系统的健康,估计到本世纪末,地球将失去50%的生物多样性。为所有已知的真核生物创建一个脱氧核糖核酸序列数字文库,有助于为防止生物多样性丧失和病原体传播、监测和保护生态系统以及加强生态系统服务提供有效工具。

到2023年,EBP第一阶段的目标是产生代表大约9,400个分类群的参考基因组。截至目前,关联项目已产生约200个此类参考基因组,预计到2022年底,将完成3000多个此类参考基因组的测序、组装和注释,约占第一阶段目标的三分之一。

该项目涵盖加州基因组保护项目(美国)、达尔文生命之树项目(英国和爱尔兰)、脊椎动物基因组项目和10000只鸟类基因组项目。

到2021年12月,EBP项目包括来自除南极洲以外的所有大陆22个国家的44个成员机构的5000名科学家和技术人员。49个附属项目涵盖了大部分主要的真核生物类群,这些项目可以从博物馆藏品和野外生物学家那里获得成千上万的高质量样本。旨在利用脱氧核糖核酸条形码技术发现和识别物种的生物扫描项目和旨在发现可能对疫情构成威胁的新病毒的全球病毒小组项目也是附属机构。

这是一个巨大的全球性项目,被称为继人类基因组计划(HGP)之后的“下一个生物登月计划”。在项目开始之前,只有少数复杂的生命物种被测序。这个项目可以帮助我们和后代更好地了解和保护地球物种和生态系统。毕竟地球的生物多样性正在迅速丧失,人类总要努力改变这些与自己共存的生物的命运。值得注意的是,这是一项需要团结合作的工作,来自世界各地的科学家和研究机构需要真诚合作和长期投入,才能按照设定的目标实现计划。

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